多肽合成包括標準化學多肽合成、多肽修飾、多肽文庫及重組多肽表達。序貫固相多肽合成可合成5-50aa的多肽，對于大于200aa的多肽，通過片段濃縮及連接技術合成。多肽合成儀顧名思義是用于合成多肽的裝置。由于多肽合成工藝繁瑣費時，有需求自然有研發生產，這才有了多肽合成儀。
多肽合成儀以固相合成為反應原理，在密閉防爆玻璃反應器中按已知順序〔序列，一般為C端羧基末端至N端氨基末端〕不斷添加、反應、合成、操作最終得到多肽載體。
多肽合成儀的合成工藝
1、樹脂選擇與氨基酸固定
合成多肽所用高分子載體主要為三種：交聯聚苯乙烯；聚酰胺；聚乙二醇脂質樹脂。氨基酸的固定主要通過被保護氨基酸的羧基與樹脂的反應基團之間形成共價鍵來實現。
2、氨基、羧基、側鏈保護與清除
要成功合成具有特定氨基酸序列的多肽，必須保護不參與酰胺鍵形成的氨基和羧基，同時也保護氨基酸側鏈的活性基團，反應結束后去除保護基團。
近年來，FMOC合成法得到廣泛應用。羧基通常由形成酯基的方法保護，甲酯和乙酯是逐步合成保護羧基的常用方法。
3、縮氨酸化反應
固相中的肽形成反應通常是將2個對應的氨基被保護的氨基酸和羧基被保護的氨基酸放入溶液中也不形成肽鍵，為了形成酰胺鍵，將羧基活化，混合酸酐、活性酯、酰氯
4、裂解及合成肽鏈純化
BOC法采用TFAHF裂解和脫側鏈保護基，FMOC法直接采用TFA，有時也采用其他堿、光降解、氟離子和析氫等脫保護方法。合成肽鏈的進一步純化、分離和純化通常采用GX液相色譜、親和色譜、毛細管電泳等。
